Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730522E02RikQ5SP45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms