Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc1Q5NCF2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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