Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Prdm6Q3UZD5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Prdm6Q3UZD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Prdm6Q3UZD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm6Q3UZD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm6Q3UZD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms