Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms