Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brf2Q3UAW9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brf2Q3UAW9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms