Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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