Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha4Q03137 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms