Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bop1P97452 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bop1P97452 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bop1P97452 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bop1P97452 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bop1P97452 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms