Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Tmod1P49813 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Tmod1P49813 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Tmod1P49813 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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Tmod1P49813 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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Tmod1P49813 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmod1P49813 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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