Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd4P46935 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms