Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InaP46660 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InaP46660 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InaP46660 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
InaP46660 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
InaP46660 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InaP46660 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InaP46660 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InaP46660 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265 ms