Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms