Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp1P29452 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms