Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif3aP28741 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms