Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NelfeP19426 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NelfeP19426 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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