Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18525 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18525 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18525 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18525 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18525 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18525 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms