Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NclP09405 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NclP09405 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NclP09405 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NclP09405 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NclP09405 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NclP09405 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NclP09405 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NclP09405 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NclP09405 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NclP09405 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NclP09405 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NclP09405 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NclP09405 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms