Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f6O54917 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f6O54917 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms