Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm20828J3KMI7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm20828J3KMI7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20828J3KMI7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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