Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r194J3JS27 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms