Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Cdh18E9Q9Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Cdh18E9Q9Q6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Cdh18E9Q9Q6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Cdh18E9Q9Q6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Cdh18E9Q9Q6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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Cdh18E9Q9Q6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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