Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cpb1B2RS76 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpb1B2RS76 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms