Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd4A2AKM2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd4A2AKM2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms