Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700019A02RikA0A087WPV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms