Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Knop1Q9Z2Q2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms