Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms