Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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