Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn19Q9ET38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms