Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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