Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap29Q9ERB0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.4 ms