Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx12Q9ER00 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms