Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms