Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ergic1Q9DC16 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ergic1Q9DC16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.4 ms