Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
3110070M22RikQ9DAQ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
3110070M22RikQ9DAQ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms