Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D1K7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D1K7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1K7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms