Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6bQ99N09 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms