Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms