Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ophn1Q99J31 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ophn1Q99J31 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ophn1Q99J31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms