Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk4Q8VEJ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms