Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms