Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms