Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms