Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4dQ8BGV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms