Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.6Q85ZW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms