Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rtl1Q7M732 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rtl1Q7M732 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms