Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot1Q6ZQ08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms