Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms