Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm29Q6PDI5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms