Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2surpQ6NV83 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms