Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ggnbp1Q6K1E7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms